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大数据分析技术国外现状,大数据的整体技术和关键技术

来源:互联网 浏览:104次 时间:2023-04-08

MiSeq凭借其超长的测序读长一直都是大家开展16S菌群多样性分析的经典平台,然而随着测序技术的发展和微生物研究的深入,这个平台的一些短板逐渐显现,比如数据量产出低,并行检测样本少,运行时间长等,这些制约着微生物组学科研人员快速开展大规模样本检测,以及获取更多数据量进行菌种精准鉴定的研究实践。

2019年NovaSeq?平台的推出彻底改变了上述状况,其提供的PE250模式,在保持数据量高产出的同时,也缩短了运行周期,完全匹配微生物组学研究对长读长、高数据量、大样本量的需求。在NovaSeq?平台上,你可以一次上机测序成百上千份微生物样本,因为不用再多次上机,大幅缩短了获取完整实验结果的时间。

NovaSeq PE250 扩增子测序的更优选择? ? ? ? ? ? ? ? ??

如果你对NovaSeq PE250是否能像MiSeq PE300那样胜任菌群多样性分析工作有犹豫。咱们来看看NovaSeq的16S rRNA基因双可变区(V3+V4)实测数据吧。

Round1:16S rRNA基因测序数据质量比较 表2细菌16S rRNA基因测序质量 以上数据表明,NovaSeq和MiSeq的数据质量都很不错,而NovaSeq的数据质量明显更优,碱基质量Q30在90%以上,有效数据量占比更高。 Round2:α多样性指数比较 上述数据表明,NovaSeq测序数据的多样性指数稍高于MiSeq,鉴定到的菌群会更丰富一些。 Round3:菌群分类学鉴定比较 MiSeq PE300与NovaSeq PE250测序数据在门水平的物种相对丰度柱形图(Top30) MiSeq PE300与NovaSeq PE250平台数据在种水平的物种相对丰度柱形图(Top30) 以上数据表明,NovaSeq与MiSeq平台得到的物种组成及丰度分布比例保持高度一致,优势物种分布没有差别。 好消息!免费升至5万Tags 看了上述数据比较,你是不是对NovaSeq PE250充满了信心,想要马上体验呢!还有个好消息告诉你,为充分发挥NovaSeq平台数据量高产出的优势,从现在起,我们为采用NovaSeq PE250检测16S菌群多样性(双区V3+V4)的老师,当然也包括ITS菌群多样性检测,免费升级测序数据至5万Tags,满足你大数据量、大样本量、精准鉴定菌种的需求。我们还会为你提供更短的实验周期(相比以往缩减30%) 心动不如行动! 马上联系我们吧 // 相关阅读// 客户文章:16S+代谢组炼就8分肠道菌群文章 | 微生物专题 Nature Milestones系列 | 微生物里有大文章!细菌孤独么?Nature Milestones:人类微生物研究里程碑事件系列一 | 微生物专题肠道菌群怎样通过“微生物-肠-脑便宜美国vps”轴影响脑功能|微生物专题 Nat Med:肠道菌群–胆汁酸–白介素22轴协同调节多囊卵巢综合征 | 微生物专题 什么?没有阳性结果也可以发Nature主刊!|人类胎盘无菌|微生物组 一文了解菌群在胃肠道不同部位的分布特征 | 微生物专题 肠道菌群与疾病因果性的研究策略 | 微生物专题 94768581